第三次党代会确定了学校新时代的奋斗目标：把科大建设成为拥有世界一流学科的高水平特色大学。为实现这一奋斗目标，从现在开始到本世纪中叶，分三个阶段安排：

　　第一阶段，未来五年，学校主要办学指标取得明显进步，实现院士等高端人才的重大突破，国家级教学成果奖和科技奖再有收获，轻工技术与工程、食品科学与工程学科力争进入国家“双一流”建设行列，基本完成两校区布局优化调整，服务滨海新区能力进一步提高，师生获得感、幸福感显著提升。

　　第二阶段，到2035年前后，办学特色和优势进一步彰显，办学水平和服务能力显著提高，成为支撑引领滨海新区高质量发展的人才培养高地、科技创新高地、成果转化高地、文明示范高地。

　　第三阶段，到本世纪中叶，即建校100周年前后，优势学科跻身世界一流行列，学校综合实力和国际影响力显著增强，全面建成拥有世界一流学科的高水平特色大学。

　　 “志之所趋，无远弗届；志之所向，无坚不入。”要实现目标，需要脚踏实地、砥砺拼搏。全校广大师生员工必须强化机遇意识、忧患意识、进取意识，以更高的标准、更严的要求、更好的状态推进学校改革发展稳定各项工作，锲而不舍、厚积薄发，不断开创高水平特色大学建设新局面。